Pius IX
Paus Pius IX, die op dat moment de Pauselijke Stoel bezette, was oorspronkelijk gezien als een potentiële hervormer binnen de Kerk. Zijn houding tegenover de Italiaanse eenwording had echter geleid tot een daling van zijn populariteit. Deze zaak zou zijn imago verder beïnvloeden en bijdragen aan de complexiteit van zijn pausschap.
Verrassend genoeg was Edgardo Mortara zelf niet direct betrokken bij de beslissing om hem van zijn familie te scheiden. Dit besluit werd genomen door anderen, zonder zijn begrip of toestemming, een feit dat de situatie nog schrijnender maakt.